Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5935Q497S0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5935Q497S0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms