Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Carmil2Q3V3V9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms