Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms