Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms