Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms