Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms