Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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