Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms