Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms