Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b2Q3UJB0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms