Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam35aQ3UEN2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam35aQ3UEN2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms