Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr41Q3UDP0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr41Q3UDP0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms