Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf180Q3U827 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf180Q3U827 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf180Q3U827 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf180Q3U827 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms