Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms