Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms