Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms