Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms