Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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