Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms