Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nlrx1Q3TL44 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nlrx1Q3TL44 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nlrx1Q3TL44 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrx1Q3TL44 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms