Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms