Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms