Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
V1rd19Q3KNP5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms