Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdss1Q33DR2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdss1Q33DR2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdss1Q33DR2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss1Q33DR2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss1Q33DR2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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