Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms