Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm1123Q1RME4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms