Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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