Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms