Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms