Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms