Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
StumQ0VBF8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms