Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms