Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap5bQ0V8T8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.5 ms