Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms