Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms