Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms