Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms