Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms