Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CkbQ04447 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CkbQ04447 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms