Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl7Q03366 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms