Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms