Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai1Q02085 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms