Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms