Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms