Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms