Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms