Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms