Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms