Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms