Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms